Le 14 septembre 2026, une revue systématique et méta-analyse de quatre essais randomisés a conclu que les données ne permettent pas d’établir un bénéfice fiable à court terme de la transplantation de microbiote fécal contre le portage intestinal de bactéries multirésistantes. Publiée dans Antimicrobial Resistance & Infection Control, cette synthèse réunit 202 participants et laisse subsister une importante incertitude sur l’effet du traitement.
L'Essentiel
Une décolonisation recherchée à court terme
Les bactéries multirésistantes résistent à plusieurs antibiotiques. Leur présence dans l’intestin constitue un réservoir susceptible de favoriser des infections et leur transmission. La décolonisation désigne ici la disparition du portage bactérien recherchée par des analyses microbiologiques.
La transplantation de microbiote fécal, aussi appelée greffe fécale, vise à transférer des micro-organismes intestinaux provenant d’un donneur. Dans cette revue, son efficacité était évaluée au point de suivi le plus proche entre 28 et 48 jours. En France, la greffe fécale se pratique uniquement en milieu hospitalier.
Pour constituer leur synthèse, les chercheurs ont recherché les études jusqu’au 18 juin 2026 dans quatre bases bibliographiques. Ils ont retenu des essais randomisés, dans lesquels l’attribution des interventions se fait par tirage au sort. Un groupe témoin permet notamment de tenir compte d’une décolonisation spontanée, qui peut conduire les études non contrôlées à surestimer l’efficacité apparente.
Une estimation trop imprécise pour confirmer le bénéfice
L’analyse principale aboutit à un risque relatif de décolonisation de 1,21, avec un intervalle de confiance à 95 % allant de 0,79 à 1,85 et une valeur p de 0,39. Le risque relatif compare la probabilité de décolonisation entre les groupes. L’intervalle traduit l’incertitude autour de cette estimation : il reste compatible avec un bénéfice comme avec une absence d’effet.
Avec seulement quatre essais et 202 participants, les données randomisées sont jugées insuffisantes pour établir un bénéfice cliniquement fiable.
Un résultat non statistiquement significatif ne démontre pas que la transplantation est dépourvue d’effet. La revue porte toutefois sur un suivi court et ne permet pas de conclure à une réduction durable du portage.
Dans l’essai indien, des taux de décolonisation proches
Un essai randomisé en double aveugle mené en Inde a inclus 114 patients : 58 ont reçu une transplantation et 56 une intervention témoin. La transplantation était réalisée par coloscopie, un examen de l’intérieur du côlon. Le groupe témoin recevait une injection de sérum physiologique lors d’une sigmoïdoscopie, un examen limité à la partie basse du côlon.
Après une séance, la décolonisation a été constatée chez 31,0 % des participants du groupe transplantation et 30,4 % du groupe témoin, sans différence significative. Des changements de diversité et de composition du microbiote ont également été observés après transplantation, sans amélioration significative de la décolonisation.
Des effets indésirables difficiles à quantifier
Des épisodes de diarrhée étaient plus fréquents dans certains groupes ayant reçu l’intervention. L’estimation groupée exploratoire de ce risque n’était cependant pas robuste aux analyses de sensibilité. Les définitions et le recueil de la diarrhée, ainsi que les traitements associés, variaient entre les essais.
Les événements indésirables graves ou sévères n’ont pas pu être regroupés de façon fiable, leurs définitions étant trop hétérogènes. En présence de sang abondant, de selles noires, de fièvre, d’une douleur intense ou d’une perte de poids, consultez rapidement.
La durée d’une éventuelle décolonisation, les patients susceptibles d’en bénéficier et les protocoles adaptés restent à déterminer. L’effet sur les infections elles-mêmes, au-delà des analyses microbiologiques de suivi, demeure également une question de recherche.
Référence : Fecal microbiota transplantation for intestinal decolonization of multidrug-resistant organisms: a systematic review, meta-analysis, and GRADE assessment of randomized controlled trials, Antimicrobial Resistance & Infection Control, 14 septembre 2026.
Sources
- pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/42008253
