Mis à jour le 12 novembre 2026
La diarrhée sous antibiotiques est un effet indésirable fréquent, généralement léger à modéré. Si elle apparaît pendant ou après le traitement, buvez régulièrement et contactez le prescripteur avant toute modification de l’antibiotique. Certaines situations nécessitent de rechercher une infection à Clostridioides difficile, une bactérie qui peut provoquer une diarrhée associée aux antibiotiques.

À retenir
- La priorité immédiate est de compenser les pertes de liquide.
- La décision de poursuivre, de changer ou d’arrêter l’antibiotique revient au prescripteur.
- L’évolution et les symptômes associés orientent les examens éventuels.
- Une diarrhée sous antibiotiques n’est pas automatiquement une infection à Clostridioides difficile.
L'Essentiel
Un effet secondaire courant, avec plusieurs causes possibles
Une diarrhée survient au cours de 5 à 25 % des traitements antibiotiques. Autrement dit, sur un ensemble de traitements, cet effet concerne une part notable des personnes, mais reste habituellement léger à modéré. Le terme « diarrhée associée aux antibiotiques » décrit le lien avec une antibiothérapie, autrement dit un traitement par antibiotiques.
Face à un épisode de diarrhée, le contexte compte : le traitement en cours, le moment d’apparition des selles liquides et leur évolution aident à orienter l’évaluation. La survenue pendant une antibiothérapie est un élément utile, mais elle n’identifie pas à elle seule la cause exacte.
Clostridioides difficile est en cause dans 10 à 20 % des diarrhées provoquées par des antibiotiques. Cette infection représente donc une partie des cas, et non l’ensemble des épisodes. Distinguer un effet indésirable transitoire d’une infection demande de tenir compte des symptômes et, lorsque cela est indiqué, de réaliser un examen.
Faut-il poursuivre ou arrêter l’antibiotique ?
Contactez le médecin prescripteur, celui qui a prescrit le traitement, pour lui signaler la diarrhée. La décision d’arrêter ou de modifier l’antibiotique se discute avec lui. L’apparition de selles liquides ne conduit donc pas à une même décision pour toutes les personnes traitées.
Si l’antibiothérapie doit se poursuivre, un changement d’antibiotique peut être envisagé. Une recherche de Clostridioides difficile peut également être effectuée. Le choix du traitement et la recherche de la cause de la diarrhée sont deux décisions liées, mais distinctes : changer l’antibiotique et prescrire un examen ne répondent pas exactement à la même question.
Lors de cet échange, décrivez quand la diarrhée a commencé par rapport au traitement et si elle diminue, reste identique ou s’aggrave. Mentionnez également si le traitement est encore en cours ou déjà terminé. Ces repères permettent de discuter de la situation concrète plutôt que du seul mot « diarrhée ».

Boire régulièrement et repérer la déshydratation
La réhydratation consiste à compenser les pertes de liquide liées à la diarrhée. Elle est essentielle pendant cet épisode : buvez régulièrement, y compris pendant que vous attendez l’échange avec le prescripteur. Cette mesure répond aux pertes de liquide, quelle que soit la décision prise ensuite concernant l’antibiotique.
Des solutions de réhydratation orale, des préparations à boire destinées à compenser les pertes d’eau et de sels, peuvent être utilisées. Elles ont notamment une place chez les personnes âgées ou lorsque vomissements et diarrhée sont associés. Le pharmacien peut vous conseiller sur leur utilisation.
La déshydratation correspond à un manque d’eau dans l’organisme. Elle peut se manifester par une soif marquée, une diminution des urines ou une accélération du pouls. Un pli de peau qui persiste après avoir été pincé et des troubles de la vigilance, comme une attention anormalement diminuée, font aussi partie des signes possibles.
Demandez rapidement un avis médical en présence de sang dans les selles, de fièvre, d’une diarrhée sévère, persistante ou qui s’aggrave, ou de signes de déshydratation. La quantité de liquide que vous arrivez à boire et l’évolution de vos urines sont des éléments concrets à décrire au professionnel de santé.
Quand rechercher Clostridioides difficile ?
Une recherche microbiologique, un examen destiné à identifier un micro-organisme responsable d’une infection, peut être indiquée si la diarrhée persiste au-delà du 4e ou du 5e jour. Son aggravation, la présence de fièvre ou des signes de gravité peuvent également justifier cet examen.
La situation est aussi évaluée avec une attention particulière chez une personne immunodéprimée, dont les défenses immunitaires sont affaiblies. Le contexte de santé intervient donc dans la décision de rechercher une infection, au même titre que l’évolution des troubles digestifs.
Les symptômes seuls ne permettent pas d’affirmer qu’il s’agit de Clostridioides difficile. Le traitement spécifique de cette infection est réservé aux cas confirmés. La démarche consiste ainsi à identifier l’infection avant de choisir le traitement qui lui correspond, plutôt qu’à traiter toute diarrhée sous antibiotiques de la même manière.
Antidiarrhéiques et probiotiques : des limites à connaître
Les médicaments antidiarrhéiques ne doivent pas être utilisés dans le contexte d’une diarrhée associée à une antibiothérapie. Si vous envisagez un médicament contre la diarrhée, signalez donc au pharmacien que les troubles sont apparus pendant ou après un traitement antibiotique : ce contexte est déterminant pour le conseil.
Les probiotiques sont des micro-organismes vivants pris par voie orale. Leur efficacité, en prévention comme pour traiter une diarrhée associée aux antibiotiques, n’a pas été démontrée. Associer probiotiques et antibiotiques ne constitue donc pas une réponse dont le bénéfice est établi dans cette situation précise.
La distinction entre prévenir et traiter est utile : prendre un produit avant l’apparition de la diarrhée vise à éviter l’épisode ; le prendre une fois les troubles présents vise à les réduire. Pour les probiotiques par voie orale, l’efficacité n’est démontrée dans aucun de ces deux usages pour cette diarrhée.
Questions courantes
Combien de temps la diarrhée peut-elle durer après l’arrêt de l’antibiotique ?
Elle disparaît souvent en quelques jours après l’arrêt du traitement. Cet arrêt reste une décision à discuter avec le prescripteur.
Peut-on avoir une infection à Clostridioides difficile sans avoir pris d’antibiotiques ?
Oui, cette infection peut aussi survenir sans prise antérieure d’antibiotiques. Une antibiothérapie récente est donc un élément du contexte, pas une condition obligatoire.
Une infection à Clostridioides difficile peut-elle revenir ?
Oui. Le risque de récidive, autrement dit de retour de l’infection, peut atteindre 20 à 30 % dans les deux mois.
Pendant l’évolution des troubles, consignez les changements utiles : amélioration ou aggravation des selles, capacité à boire et quantité d’urines. Ces observations rendent les échanges avec le prescripteur plus précis, notamment si le traitement antibiotique est déjà terminé.
Sources
- www.vidal.fr/maladies/recommandations/diarrhee-aigue-de-l-adulte-1622.html
- www.ameli.fr/assure/sante/themes/gastro-enterite-adulte/consultation-traitement
- www.has-sante.fr/jcms/p_3498127/fr/dificlir-fidaxomicine-infection-a-clostridium-difficile